Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf11aO35305 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms