Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EllO08856 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EllO08856 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
EllO08856 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EllO08856 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EllO08856 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
EllO08856 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EllO08856 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EllO08856 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms