Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms