Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17078M0QW51 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm17078M0QW51 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm17078M0QW51 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17078M0QW51 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms