Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc180J3QNE4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc180J3QNE4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms