Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21411J3KMS0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21411J3KMS0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21411J3KMS0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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