Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20708H3BKF4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20708H3BKF4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms