Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms