Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms