Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm5861F6VCN9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm5861F6VCN9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms