Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms