Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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