Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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