Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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