Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc17E9PVB5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms