Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan18E9PUD6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms