Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms