Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6685D3YYP3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms