Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms