Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms