Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2B9EJA2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms