Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Phf11cB4XVP9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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