Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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