Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms