Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms