Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SetxA2AKX3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms