Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms