Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Prdm16A2A935 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm16A2A935 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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