Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171a2A2A699 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms