Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms