Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms