Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms