Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms