Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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