Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms