Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms