Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms