Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms