Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms