Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LitafQ9JLJ0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LitafQ9JLJ0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LitafQ9JLJ0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LitafQ9JLJ0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LitafQ9JLJ0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LitafQ9JLJ0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms