Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms