Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup50Q9JIH2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup50Q9JIH2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms