Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms