Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms