Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Usp29Q9ES63 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp29Q9ES63 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp29Q9ES63 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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