Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim54Q9ERP3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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