Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SgshQ9EQ08 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SgshQ9EQ08 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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