Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SlirpQ9D8T7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms