Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns2Q9D7J7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms