Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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